Person

DI (FH) Viktoria Dorfer MSc

Ausbildung

Johannes Kepler Universität Linz
Nov. 2012 - dato
FH OÖ Campus Hagenberg, Biomedizinische Informatik, MSc.
Okt. 2009 - Juli 2011
FH OÖ Campus Hagenberg, Bioinformatik, Dipl.-Ing. (FH)
Okt. 2003 - Sep. 2007
Akademisches Gymnasium Linz
Sep. 1995 - Juli 2003

Berufliche Laufbahn & Aktivitäten

FH OÖ, Studiengang für Medizin- und Bioinformatik, Assistentin der Lehre für Machine Learning, Proteomics
März 2016 - dato
FH OÖ Forschungs & Entwicklungs GmbH, wissenschaftliche Mitarbeiterin
Okt. 2007 - Feb. 2016
2019
S. Dorl, S. M. Winkler, K. Mechtler, V. Dorfer - MS Ana: A spectral library search engine optimized for high-accuracy fragment ion data - Proceedings of the 2019 EuBIC Winter School on proteomics bioinformatics, Zakopane, Polen, 2019 mehr
2018
E. W. Deutsch, Y. Perez-Riverol, R. J. Chalkley, M. Wilhelm, S. Tate, T. Sachsenberg, M. Walzer, L. Käll, B. Delanghe, S. Böcker, E. L. Schymanski, P. Wilmes, V. Dorfer, B. Küster, P. Volders, N. Jehmlich, J. Vissers, D. W. Wolan, A. Y. Wang, L. Mendoza, J. Shofstahl, A. W. Dowsey, J. Griss, R. Salek,… mehr
2018
S. Willems, D. Bouyssie, D. Deforce, V. Dorfer, V. Gorshkov, D. Kopczynski, K. Laukens, M. Locard-Paulet, V. Schwämmle, J. Uszkoreit, D. Valkenborg, M. Vaudel, W. Bittremieux - Proceedings of the EuBIC developer's meeting 2018 - Journal of Proteomics, 2018, pp. 25-27 mehr
2018
V. Dorfer, S. Maltsev, S. M. Winkler, K. Mechtler - CharmeRT: Boosting Peptide Identifications by Chimeric Spectra Identification and Retention Time Prediction - Journal of Proteome Research, 2018, pp. 2581-2589 mehr
2017
S. Willems, D. Bouyssie, M. David, M. Locard-Paulet, K. Mechtler, V. Schwämmle, J. Uszkoreit, M. Vaudel, V. Dorfer - Proceedings of the EuBIC Winter School 2017 - Journal of Proteomics, 2017, pp. 78-80 mehr
2017
S. Dorl, S. M. Winkler, K. Mechtler, V. Dorfer - Identifying tandem mass spectra of phosphorylated peptides before database search using machine-learning - Proceedings of the 2017 EuBIC Winter School on proteomics bioinformatics, Semmering, Österreich, 2017 mehr
2017
S. Dorl, S. M. Winkler, K. Mechtler, V. Dorfer - PhoStar: Identifying Tandem Mass Spectra of Phosphorylated Peptides before Database Search - Journal of Proteome Research, 2017 mehr
2016
D. M. Borgmann, S. Mayr, H. Polin, S. Schaller, V. Dorfer, L. Obritzberger, T. Endmayr, C. Gabriel, S. M. Winkler, J. Jacak - Single Molecule Fluorescence Microscopy and Machine Learning for Rhesus D Antigen Classification - Scientific Reports, Vol. 6, No. 32317, 2016 mehr
2016
S. Mayr, D. M. Borgmann, H. Polin, S. Schaller, T. Endmayr, L. Obritzberger, V. Dorfer, C. Gabriel, S. M. Winkler, J. Jacak - Classification of Rhesus D Antigen Expression at Single Molecule Level by High-Resolution Fluorescence Microscopy and Machine Learning - Proceedings of the Annual Winterworkshop,… mehr
2016
S. Dorl, S. M. Winkler, K. Mechtler, V. Dorfer - Identifying tandem mass spectra of phosphorylated peptides before database search using machine-learning - Proceedings of the Austrian Proteomics Research Symposium (APRS2016), Wien, Österreich, 2016 mehr
2015
D. M. Borgmann, S. Mayr, H. Polin, L. Obritzberger, S. Schaller, V. Dorfer, J. Jacak, S. M. Winkler - Classifying Human Blood Samples Using Characteristics of Single Molecules and Cell Structures on Microscopy Images - Lecture Notes in Computer Science LNCS 9520, Las Palmas, Gran Canaria, Spanien, 2015,… mehr
2015
S. M. Winkler, S. Schaller, D. M. Borgmann, V. Dorfer, M. Affenzeller, J. Jacak, H. Redl, J. Weghuber - Identification and classification of objects and motions in microscopy images of biological samples using heuristic algorithms in Studies in Computational Intelligence (Contributions to Book: Part/Chapter/Section… mehr
2015
V. Dorfer, S. Maltsev, S. Dreiseitl, K. Mechtler, S. M. Winkler - A Symbolic Regression Based Scoring System Improving Peptide Identifications for MS Amanda - Proceedings of the 11th GECCO Workshop on Medical Applications of Genetic and Evolutionary Computation MedGEC, Madrid, Spanien, 2015 mehr
2015
V. Dorfer, S. Maltsev, S. M. Winkler, K. Mechtler - Chimeric MS/MS Spectra Identification using MS Amanda - Proceedings of 63rd ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics (ASMS 2015), St. Louis, Vereinigte Staaten von Amerika, 2015 mehr
2015
L. Obritzberger, D. M. Borgmann, S. Schaller, V. Dorfer, A. Lindenmair, S. Wolbank, H. Redl, S. M. Winkler - Prediction of Mineralization Degree in Human Amniotic Membrane Using Image Processing Techniques and Machine Learning - Proceedings of the 11th Metaheuristics International Conference, Agadir,… mehr
2015
L. Obritzberger, D. M. Borgmann, S. Schaller, V. Dorfer, A. Lindenmair, S. Wolbank, S. Hennerbichler, H. Redl, S. M. Winkler - Prediction of Stem Cell Differentiation in Human Amniotic Membrane Microscopy Images Using Machine Learning - Lecture Notes in Computer Science LNCS 9520, Las Palmas, Gran Canaria,… mehr
2014
V. Dorfer, P. Pichler, T. Stranzl, J. Stadlmann, T. Taus, S. M. Winkler, K. Mechtler - MS Amanda, a Universal Identification Algorithm Optimized for High Accuracy Tandem Mass Spectra - Journal of Proteome Research, Vol. 13, No. 8, 2014, pp. 3679-3684 mehr
2014
V. Dorfer, G. Dürnberger, S. M. Winkler, K. Mechtler - Searching Chimeric MS/MS Spectra with MS Amanda - Proceedings of the 12th Austrian Proteomic Research Symposium (APRS 2014), Salzburg, Österreich, 2014 mehr
2014
V. Dorfer, P. Pichler, T. Stranzl, G. Dürnberger, S. M. Winkler, K. Mechtler - A Standalone Version of MS Amanda for Integration into Proteomics Workflows - Proceedings of the 13th Human Proteome Organization World Congress (HUPO 2014), Madrid, Spanien, 2014 mehr
2014
V. Dorfer, P. Pichler, T. Stranzl, S. M. Winkler, K. Mechtler - MS Amanda Stand-Alone for Integration in Proteomics Workflows - Proceedings of 62rd ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics (ASMS 2014), Baltimore, Vereinigte Staaten von Amerika, 2014 mehr
2014
L. Obritzberger, S. Schaller, V. Dorfer, C. Loimayr, S. Hennerbichler, S. M. Winkler - Identification of Endothelial Cell Morphology in Cornea Using Evolution Strategies - Proceedings of the 26th European Modeling and Simulation Symposium EMSS 2014, Bordeaux, Frankreich, 2014 mehr
2014
S. M. Winkler, S. Schaller, V. Dorfer, M. Affenzeller, G. Petz, M. Karpowicz - Data-based prediction of sentiments using heterogeneous model ensembles - Soft Computing, 2014, pp. 12 mehr
2014
S. Wagner, G. K. Kronberger, A. Beham, M. Kommenda, A. Scheibenpflug, E. Pitzer, S. Vonolfen, M. Kofler, S. M. Winkler, V. Dorfer, M. Affenzeller - Architecture and Design of the HeuristicLab Optimization Environment in Advanced Methods and Applications in Computational Intelligence (Contributions to… mehr
2013
V. Dorfer, P. Pichler, S. M. Winkler, K. Mechtler - MS Amanda: A Novel Algorithm for the Identification of High Accuracy Tandem Mass Spectrometry Data - Proceedings of 11th Austrian Proteomic Research Symposium (APRS 2013), Innsbruck, Österreich, 2013 mehr
2013
V. Dorfer, P. Pichler, S. M. Winkler, K. Mechtler - MS Amanda: A Novel Algorithm for the Identification of High Accuracy Tandem Mass Spectrometry Data - Proceedings of 61st ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics, Minneapolis, Vereinigte Staaten von Amerika, 2013 mehr
2012
V. Dorfer, P. Pichler, S. M. Winkler, K. Mechtler - Identifying HCD & ETD spectra – a new approach - Proceedings of the 10th Austrian Proteomic Research Symposium, Graz, Österreich, 2012 mehr
2012
S. Schaller, S. M. Winkler, V. Dorfer, G. Petz, H. Fürschuß - A Machine Learning Suite for Opinion Mining in Web 2.0 - Proceedings of IEEE APCAST'12 Conference, Sydney, Australien, 2012, pp. 10-13 mehr
2012
H. Fürschuß, G. Petz, P. Faschang, S. Schaller, S. M. Winkler, V. Dorfer - Qualitative Bedarfserhebung an Opinion Mining Tools im Web 2.0 - Tagungsband des 6. Forschungsforums der österreichischen Fachhochschulen, Graz, Österreich, 2012, pp. 33-36 mehr
2011
V. Dorfer, S. M. Winkler, T. Kern, S. Blank, G. Petz, P. Faschang - Keyword Clustering in Biomedical Information Retrieval Using Evolutionary Algorithms - Proceedings of the 19th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB) and 10th European Conference on Computational… mehr
2011
P. Faschang, G. Petz, V. Dorfer, T. Kern, S. M. Winkler - Vorgehensmodell für Opinion Mining im Web 2.0 - Tagungsband FFH 2011 (5. Forschungsforum der österreichischen Fachhochschulen), Wien (Favoriten), Österreich, 2011, pp. 144-147 mehr
2011
V. Dorfer, S. M. Winkler, T. Kern, G. Petz, P. Faschang - Analysis of Single-Objective and Multi-Objective Evolutionary Algorithms in Keyword Cluster Optimization - Proceedings of International Conference on Computer Aided Systems Theory EUROCAST 2011, Las Palmas, Spanien, 2011, pp. 3 mehr
2011
S. Wagner, A. Beham, G. K. Kronberger, M. Kommenda, E. Pitzer, M. Kofler, S. Vonolfen, S. M. Winkler, V. Dorfer, M. Affenzeller - HeuristicLab 3.3: Ein erweiterbares und flexibles Softwaresystem für heuristische Optimierung - Tagungsband FFH 2011 (5. Forschungsforum der österreichischen Fachhochschulen),… mehr
2011
V. Dorfer - On the Optimization of Keyword Clustering Using Evolutionary Algorithms - Master/Diploma Thesis, FH OÖ Fakultät Hagenberg, Österreich, 2011, pp. 1-50 mehr
2011
P. Faschang, G. Petz, V. Dorfer, T. Kern, S. M. Winkler - An Approach to Mining Consumer's Opinion on the Web - Proceedings of the 13th International Conference on Computer Aided Systems Theory (EUROCAST 2011), Las Palmas de Gran Canaria, Spanien, 2011, pp. 37-39 mehr
2011
V. Dorfer, S. M. Winkler, T. Kern, S. Blank, G. Petz, P. Faschang - On the Performance of Evolutionary Algorithms in Biomedical Keyword Clustering - Proceedings of the Genetic and Evolutionary Computation Conference GECCO 2011, Dublin, Irland, 2011 mehr
2011
P. Faschang, G. Petz, M. Wimmer, V. Dorfer, S. M. Winkler - Evaluation of Tools for Opinion Mining - Proceedings of the 2011 international Conference on E-Learning, E-Business, Enterprise Information Systems & E-Government, Las Vegas, Vereinigte Staaten von Amerika, 2011, pp. 3-9 mehr
2010
S. Wagner, A. Beham, G. K. Kronberger, M. Kommenda, E. Pitzer, M. Kofler, S. Vonolfen, S. M. Winkler, V. Dorfer, M. Affenzeller - HeuristicLab 3.3: A unified approach to metaheuristic optimization - Actas del séptimo congreso español sobre Metaheurísticas, Algoritmos Evolutivos y Bioinspirados (MAEB'2010),… mehr
2010
V. Dorfer, S. M. Winkler, T. Kern, G. Petz, P. Faschang - Optimization of Keyword Grouping in Biomedical Information Retrieval Using Evolutionary Algorithms - 22nd European Modeling and Simulation Symposium EMSS 2010, Fes, Marokko, 2010, pp. 25-30 mehr
2009
C. Frech, M. Kommenda, V. Dorfer, T. Kern, H. Hintner, J. W. Bauer, K. Oender - Improved Homology-driven Computational Validation of Protein-Protein Interactions Based on Evolutionary Gene Duplication and Divergence Hypothesis - BMC Bioinformatics, Vol. 10, No. 1, 2009, pp. 18 mehr
2009
T. Kern, M. Kommenda, V. Dorfer, J. W. Bauer, K. Oender - PRIMOS: AN INTEGRATED PLATFORM FOR EXPLORING PROTEIN-PROTEIN INTERACTIONS - Proceedings of 21st European Modeling and Simulation Symposium EMSS 2009, Tenerife, Spanien, 2009, pp. 6 mehr
2008
M. Kommenda, C. Frech, V. Dorfer, T. Kern, J. W. Bauer, K. Oender - Integration und Bereinigung von Protein-Protein-Interaktionsdaten - Proceedings of FFH2008 Fachhochschul Forschungs Forum, Wels, Österreich, 2008, pp. 434-438 mehr
2013
Fluorescence microscopy is going to become one of the core technologies for biomedical research and diagnostics. Therefore, image analysis is an increasing challenge for biomedical researchers. In the… mehr
2013
Zur Identifikation von Proteinen in biologischen Proben kommt üblicherweise Massenspektrometrie (MS) zum Einsatz: Proteine werden verdaut, die daraus resultierenden Peptide (Fragmente von Proteinen)… mehr
2011
Im Rahmen des Projekts MS Amanda entwickelt die FH OÖ Forschungs & Entwicklungs GmbH an der Fakultät für Informatik, Kommunikation und Medien eine prototypische Implementierung von Algorithmen… mehr
2010
In unserer modernen Wissensgesellschaft stellt der effektive Umgang mit meist unstrukturierteren und exponentiell wachsenden Datenmengen eine der größten Herausforderungen an die Informatik… mehr
2010
In unserer modernen Wissensgesellschaft stellt der effektive Umgang mit meist unstrukturierteren und exponentiell wachsenden Datenmengen eine der größten Herausforderungen an die Informatik dar. Der… mehr
2010
Das Web 2.0 beeinflusst und gestaltet die Art und Weise unserer Kommunikation maßgeblich: Konsumenten tauschen sich über Web 2.0 Anwendungen wie Wikis, Blogs, Community Sites aus und generieren… mehr
2007
Gute Entscheidungen hängen von guten Informationen ab. Im speziellen Fall der Feuerwehr müssen Entscheidungen nicht nur richtig sondern auch rasch getroffen werden. Und zwar vor Ort, während die Informationen… mehr
2003
Den menschlichen Körper und seine interzellularen Prozesse zu verstehen, detailliertes Wissen über Gesundheit und Krankheit zu erhalten und bessere Diagnose- und Behandlungsmöglichkeiten zu entwickeln… mehr