Publikation

Integration und Bereinigung von Protein-Protein-Interaktionsdaten

Outline:

M. Kommenda, C. Frech, V. Dorfer, T. Kern, J. W. Bauer, K. Oender - Integration und Bereinigung von Protein-Protein-Interaktionsdaten - Proceedings of FFH2008 Fachhochschul Forschungs Forum, Wels, Österreich, 2008, pp. 434-438

Abstract:

Nahezu jeder Prozess innerhalb einer Zelle eines Organismus wird durch das Zusammenspiel mehrerer Proteine beeinflusst und gesteuert. Erst das Wissen über diese Protein-Protein-Interaktionen (PPIs) ermöglicht es, biologische Prozesse auf molekularer Ebene zu verstehen. Durch intensive Forschung wurde in den letzten Jahren eine große Anzahl an PPI-Daten generiert und weltweit in unterschiedlichen Interaktionsdatenbanken gespeichert. Durch die Heterogenität der Interaktionsdatenbanken ist es beinahe unmöglich umfangreiches Wissen bzw. einen Überblick über die Interaktionen eines Proteins zu erhalten, ohne langwierig in mehreren Datenbanken zu recherchieren. Ein Bioinformatik-Forschungsprojekt am FH OÖ Campus Hagenberg löst dieses Problem durch die Entwicklung intelligenter Software-Werkzeuge für Molekularbiologen und Pharmakologen.